Arhn - архитектура программирования

Применение определенной формулы к большой матрице/фрейму данных в R, чтобы нормализовать мои данные

У меня есть большая «матрица расстояний» (фактически кадр данных 170x170 в R), например:

         A            B          C
A   0.198395022 0.314012433 0.32704998
B   0.314012433 0.262514533 0.318539233
C   0.32704998  0.318539233 0.211224133

Я пытаюсь применить конкретную формулу (которая у меня уже есть), чтобы привести эту вариацию к масштабу 0-1, как это требуется для моего статистического моделирования. Я ожидаю получить что-то подобное по всему фрейму данных (ожидаемый результат при применении формулы):

          A              B              C
A        1          0.846050953    0.825897603
B   0.846050953          1         0.822548469
C   0.825897603     0.822548469         1

Итак, мне нужно пересчитать каждую недиагональную ячейку относительно соответствующих значений, применив эту формулу в R:

Формула здесь

где B — матрица нормализованных значений, H — моя матрица/фрейм данных, а i и j — строки и столбцы моей матрицы/фрейма данных соответственно. Предполагается, что эта процедура нормализации систематически заменяет диагональ (i = j) на 1.

Спасибо!

r dataframe formula matrix diagonal
09.01.2020

  • Пожалуйста, предоставьте воспроизводимый минимальный пример данных и вашу лучшую попытку закодировать это. Обратите внимание на инструкции в верхней части страницы тегов r. 10.01.2020

Ответы:


1

Вы можете сделать цикл, чтобы заменить каждое значение в соответствии с вашей формулой:

df <- data.frame(rnorm(3, 20,15), rnorm(3, 10,5), rnorm(3, 200,100))
df # Check out the results

for (i in 1:length(df)){   
    for (j in 1:nrow(df)){
       df[i,j] <- df[i,j]/((df[i,i]+df[j,j])/2)   
    } 
}

df ## Обратите внимание, что сделано!

09.01.2020
Новые материалы
Коллекции публикаций по глубокому обучению
Последние пару месяцев я создавал коллекции последних академических публикаций по различным подполям глубокого обучения в моем блоге https://amundtveit.com - эта публикация дает обзор 25..
Представляем: Pepita
Фреймворк JavaScript с открытым исходным кодом Я знаю, что недостатка в фреймворках JavaScript нет. Но я просто не мог остановиться. Я хотел написать что-то сам, со своими собственными..
Советы по коду Laravel #2
1-) Найти // You can specify the columns you need // in when you use the find method on a model User::find(‘id’, [‘email’,’name’]); // You can increment or decrement // a field in..
Работа с временными рядами спутниковых изображений, часть 3 (аналитика данных)
Анализ временных рядов спутниковых изображений для данных наблюдений за большой Землей (arXiv) Автор: Рольф Симоэс , Жильберто Камара , Жильберто Кейрос , Фелипе Соуза , Педро Р. Андраде ,..
3 способа решить квадратное уравнение (3-й мой любимый) -
1. Методом факторизации — 2. Используя квадратичную формулу — 3. Заполнив квадрат — Давайте поймем это, решив это простое уравнение: Мы пытаемся сделать LHS,..
Создание VR-миров с A-Frame
Виртуальная реальность (и дополненная реальность) стали главными модными терминами в образовательных технологиях. С недорогими VR-гарнитурами, такими как Google Cardboard , и использованием..
Демистификация рекурсии
КОДЕКС Демистификация рекурсии Упрощенная концепция ошеломляющей О чем весь этот шум? Рекурсия, кажется, единственная тема, от которой у каждого начинающего студента-информатика..